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专著

张兰生,方修琦等. 中国古地理——中国自然环境的形成. 科学出版社. 2012

葛全胜, 方修琦,叶谦等.全球环境变化视角下中国粮食、水与健康安全问题研究. 气象出版社. 2011

葛全胜, 方修琦等. 中国碳排放的历史与现状. 气象出版社. 2011.

参与编写

丁一汇主编：中国气候.(郑景云，方修琦，邵雪梅，王绍武，郝志新. 第八章 中国的古气候变化).科学出版社.2013

葛全胜等.中国历朝气候变化(葛全胜, 方修琦. 第一章. 史前中国气候变化). 科学出版社. 2011, 1~21.

水利部, 中国科学院, 中国工程院. 中国水土流失防治与生态安全(方修琦, 章文波. 第三章 土壤侵蚀演变).科学出版社.2010, 191~214.

孙九林, 林海主编. 地球系统研究与科学数据(方修琦, 萧凌波. 6.1人类活动对地球系统的影响与响应).科学出版社. 2008,256~275.

王五一, 杨林生. 全球环境变化与健康(方修琦. 4.1 中国环境已经发生了巨大变化).气象科学出版社.2009, 113~125.

中国科学院地学部地球科学发展战略研究组.21世纪我国地球科学发展战略研究(葛全胜, 方修琦. 3.5大规模人类活动对气候和环境的影响及适应对策).科学出版社       .2009, 188~191.

葛全胜,郑景云等. 中国自然灾害风险综合评估初步研究(方修琦,陈莉,殷培红,马丽. 第五章 国外主要灾害风险评估方法与评估模型; 方修琦,邹铭,侯光良,魏本勇,殷培红       ,刘翠华,廖永丰,童钦霖. 第十一章浙江省自然灾害风险综合评估). 科学出版社.2008.

葛全胜, 戴君虎, 何凡能等. 过去三百年中国土地利用变化与陆地碳收支(葛全胜, 方修琦, 叶瑜. 第四章 民国时期土地利用与土地覆盖变化)科学出版社, 2008. 82~107.

秦大河, 丁一汇主编. 中国气候与环境演变( 方修琦.2.2 今2万年的气候变化；任国玉.方修琦.9.4.1 过去的土地利用/覆盖变化). 北京:科学出版社.2005.

赵小鲁, 席建超主编, 重庆市乌江旅游规划.( 方修琦, 席建超, 长安. 二、旅游资源评价; 赵小鲁, 方修琦, 席建超, 宁志中.七、近期重点开发景区及呼吸产品策划). 旅游       出版社,2006.

史培军, 湖涛, 王静爱, 方修琦, 陈晋等.《内蒙古自然灾害系统研究》 海洋出版社(执笔“历史灾害”一章).1993.

金争平,史培军等著.黄河皇埔川流域土壤侵蚀系统模型和治理模式.海洋出版社(参加编写第六、七章).1992.

张兰生主编.《中国自然灾害地图集》 科学出版社(编委, 灾情和英文版文字专题负责人, 编图12幅).1992.

张兰生主编.《Natural Disasters in China》Science Press.1992.

《佳县经济发展系统研究》项目组. 陕西省佳县经济发展研究.海洋出版社(副主编, 执笔五、八２章, 参加编写４章). 1990 .